對于目前正在建設的新建檔案館更應該關注檔案保管環境的建設，檔案遭受有害微生物及害蟲污染的面積和程度可以明顯降低，但同時我們也必須清醒的認識一些歷史檔案的霉菌殘留以及新滋生的有害微生物和害蟲仍然不可小視。另外，由于信息記錄方法和記錄載體的變革，使檔案種類呈現多樣性，所以新建檔案館建立標準完善的檔案消毒系統非常必要。 

新建檔案館檔案消毒系統是指在新建檔案館過程中，通過設計安裝消毒室及消毒設備，實現檔案實時消毒。在檔案接收、利用時，對檔案進行同步消毒的方法，通常在獨立的檔案消毒室進行，建議在新館建設時，一般將檔案消毒室設計在檔案接待閱覽大廳附近，這樣便于日常消毒工作進行。檔案消毒室建設時，應安裝獨立的通風系統，并保證房間有可以打開的窗戶，便于通風換氣。檔案實時消毒應該選擇安裝高效、專業，操作方便的消毒設備，消毒設備包括檔案滅菌設備和檔案殺蟲設備。 

“檔案消毒倉系統”是專門為綜合檔案館研制的殺滅有害微生物的消毒設備，主要解決綜合檔案館檔案接收、利用過程中實時消毒的問題。檔案消毒倉系統采用的消毒方法是臭氧法，這種方法一方面提高了滅菌率，另一方面縮短了滅菌時間。